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GO数据库介绍（转载）

类似于语义网络。是为了生物界有一个统一的数据交流语言。 因为在生物学界，存在在种种同名异义、异议同名的现象。为此产生了GO项目。

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GO是用一套统一的词汇表来描述生物学中的分子功能、生物过程和细胞成分。其思想大概过程：对于一个基因产品（蛋白质或RNA），用某些词汇来描述它是干什么的或位于细胞哪里、或者参与了哪个生物过程，而这些词汇就是来自GO的Term。

（1）提供生物学功能（术语）的逻辑结构及其相互之间的关系，表现为有向无环图

（2）给特定的基因产物（蛋白质，非编码RNA或大分子复合体，简称为'基因'）起一个特定的名字（唯一标识该基因）

Gene Ontology（GO）中最基本的概念是term。GO里面的每一个entry都有一个唯一的数字标记，形如GO:nnnnnnn，还有一个term名，比如"cell", "fibroblast growth factor receptor binding"，或者"signal transduction"。每个term都属于一个ontology，总共有三个ontology，它们分别是

细胞成分：细胞的部分或其细胞外环境;

分子功能：基因产物在分子水平上的元素活性，例如结合或催化;

生物过程：具有确定开始和结束的分子事件的操作或集合，与综合生活单元的功能有关

理由一：

在基因表达谱分析中，GO常用于提供基因功能分类标签和基因功能研究的背景知识。利用GO的知识体系和结构特点，旨在发掘与基因差异表达现象关联的单个特征基因功能类或多个特征功能类的组合。

根据GO的知识体系，使用“功能类”（或者叫做“功能模块”）这一概念具有以下优点：我们认为，单个基因的表达情况的改变不足以反映特定功能/通路的整体变化情况。因为类似人类社会的组织结构，生物体的功能的实现决不仅仅是依靠一两个基因功能的改变来实现的。因此过分着重单个基因表达变化，将会在后期结果处理中严重干扰对于结果的合理分析，导致偏倚性加大，而且是无法避免的。因此利用GO的结构体系，把参与同样功能/通路的基因进行“功能类”层面的抽象和整合，提供比基因更高一层次的抽象结论，对理解疾病的发病机制或药物的作用机理等更有帮助。

但是该方法也存在一定的不足，由于生物体内部的调控网络可能具有“scale-free network”的特点，个别功能重要的基因（主效基因）具有“Hub节点”的重要特性，它的功能改变可能对于整个网络来说是至关重要的，在这点上，这些重要的基因又具有一定的“自私独裁”特点。而“功能类”之观点模糊了这种差别特性，过于强调“共性”，而忽视了“个性”，这也是“功能类”的一个不足之处，这就需要结合相关的生物学知识才能够实现

理由二：

GO（gene ontology）对大家而言也许会是一个相对陌生的名词，但是它已经成为生物信息领域中一个极为重要的方法和工具，并正在逐步改变着我们对 biological data的组织和理解方式，它的存在已经大大加快了我们对所拥有的生物数据的整合和利用，我们应该逐步学会理解和掌握这种思想和工具。

众所周知，sequence based biology中的核心内容即是对序列的Annotation（注释），其中主要包含structural annotation和functional annotation，前者涉及分析sequence在genome中的locus以及exon，intron，promoter等的location，而后者则是推断序列编码产物的功能

随着多种生物genome的相继解码，同时大量ESTs以及gene expression profile date的积累，使得annotation的工作量和复杂度大大增加。然而另一方面，大多数基因在不同真核生物中拥有共同的主要生物功能，通过在某些物种中获得的基因或者蛋白质（shared protein）的生物学信息，可以用以解释其他物种中对应的基因或蛋白（especially in comparative genomics）。由于这些繁复的功能信息主要是包含在积累的文献之中，如何有效的提取和综合这些信息就是我们面临的核心困难，这也是GO所要着力解决的问题。通过建立一套具有动态形式的控制字集（controlled vocabulary），来解释真核基因及蛋白在细胞内所扮演的角色，并随着生命科学研究的进步，不断积累和更新。一个ontology会被一个控制字集来描述并给予一定的名称，通过制定“本体”ontologies并运用统计学方法及自然语言处理技术，可以实现知识管理的专家系统控制

总结：

Gene Ontology（GO）包含了基因参与的生物过程，所处的细胞位置，发挥的分子功能三方面功能信息，并将概念粗细不同的功能概念组织成DAG（有向无环图）的结构。

Gene Ontology是一个使用有控制的词汇表和严格定义的概念关系，以有向无环图的形式统一表示各物种的基因功能分类体系，从而较全面地概括了基因的功能信息，纠正了传统功能分类体系中常见的维度混淆问题。

在基因表达谱分析中，GO常用于提供基因功能分类标签和基因功能研究的背景知识。利用GO的知识体系和结构特点，旨在发掘与基因差异表达现象关联的单个特征基因功能类或多个特征功能类的组合。

原文：

java，python，go可以同时学吗

每种语言都有自己的侧重点，如果可以的话建议题主还是分开学，循序渐进，如果学习同时学习三种语言，容易记混不说，反而容易导致学习进度停滞不前。

知了姐就来跟大家详细说说java，python，go三种语言之间的区别，仅供题主参考~

01 Python

难度：★

欢迎度：★★★★☆

创始于：1991年

**学完之后可以干什么：**web开发、应用开发、大数据、数据挖掘、科学计算、机器学习、人工智能、运维、自然语言处理等等等。

Python的优点：

• 易于学习：就像论坛里有些人说的，做了几年Java或者是C++的，几天就可以写Python了。但是这个不是什么坏事，入门来说，从简入难，或者从难入简，都是很好的选择。

• 库：库都是免费的，并且有很多库和函数把编程变得相对容易很多。

• 物联网：Python也许是会成为物联网当中最受欢迎的语言，我们都知道树莓派这样的新平台都是基于Python开发的。

Python的缺点：

速度：开发速度是快，比如java100行代码python20行就搞定了。但是作为解释型的语言来说，比编译型语言的速度慢很多。

• 移动端：Python在移动计算方面是弱的，很少有智能机的应用是Python开发的

• 设计：python是动态型的语言，需要更多的测试以及错误仅仅是在运行的时候展示的。

02 JAVA

难度：★ ★ ★

欢迎度：★ ★ ★ ★ ★

创始于：1995年

Java可以做什么：**安卓和IOS的应用开发、视频游戏开发、桌面GUI、软件开发等等；

Java是老牌语言，但是由于市场上相关开发人才较多，竞争激烈，薪资趋于平稳。

Java的优点：

• Java开发人员需求量大：这个是根据统计得出的。JAVA在很多语言当中，是需求量最大的；

• 进化语言：首先C++是基于C语言优化的，Java是被优化过来的。而且在这人平台是增加了很多的功能，lambda等功能

• 安卓应用开发：谷歌的安卓移动平台是世界第一的移动平台，编写安卓应用开发者使用的主要语言是Java；

Java的缺点：

• 使用大量的内存：Java和C++相比使用更多的内存所以占用的内存就更大

• 学习曲线：这边指的是Java虽然不是最简单的入门语言，但是也不是最难

• 启动时间慢：用java写过安卓的应用的人应该都知道。同样的代码在模拟器中启动是非常缓慢的事情。

03 GO语言

难度：★

欢迎度：★★★★☆

创始于：2007年

go语言的难度，相对来说，GO语言不难的。

可是GO语言的学习资料相对其他的语言来说很少，所以学习起来没有其他的语言那么便利；

很多人说GO语言在国内更火，按照数据来说，是的。因为中国人多，基数大。其实GO在国外更火。对于现在来说，GO实际上也已经站稳脚跟了。不管是Google自带光环也好，实际应用也好。go算是找到了属于自己的空间。

golang相对其他语言来说，招聘职位还是较少。

GO语言的优点：

• 编译时间快：GO语言编写最大的微服务的时间大概需要6秒，相对Java和C++呆滞的编译速度来说，GO语言快速编译是主要的效率优势。

• 并发性和通道：GO语言的logo大家可以了解一下，它就是致力于事情简单化，也就是快。其实并没有引入很多的新的概念。就是打造一门简单的语言，使用起来很快。在goroutine上运行一个函数最小的样板代码，我们只需要使用关键词go添加函数调用：

• 生态系统也是很强大的：面向Redis、RabbitMQ、Template等等很多稳定的库。有很强大的工具支持。

GO语言的缺点：

• 缺少框架：GO是没有一个主要的框架。但是很多人认为不应该从框架的使用开始。也可以从社区的讨论了解一下这个问题。

• 错误处理：在错误处理方式，很容易丢失错误发生范围，所以在编程过程中很难向用户提供出有意义的错误信息。

• 软件包管理：在默认的情况下，没有办法制定特定版本的依赖库，也没有办法创建可以复写的builds。

前期，咱们可以熟练掌握一门语言先找到合适的工作，拿到满意的薪水，稳定之后咱们逐渐就可以学习更多的语言，丰富技能~

go是什么意思

一是一种编程语言，另一个是动词，表示走的意思。

简介

Go是谷歌2009年发布的第二款编程语言。2009年7月份，谷歌曾发布了Simple语言，它是用来开发Android应用的一种BASIC语言。 谷歌资深软件工程师罗布·派克(Rob Pike)表示，“Go让我体验到了从未有过的开发效率。”派克表示，和今天的C++或C一样，Go是一种系统语言。他解释道，“使用它可以进行快速开发，同时它还是一个真正的编译语言，我们之所以现在将其开源，原因是我们认为它已经非常有用和强大。” 2007年，谷歌把Go作为一个20%项目开始研发，即让员工抽出本职工作之外时间的20%，投入在该项目上。除了派克外，该项目的成员还其它一些谷歌工程师。 派克表示，编译后Go代码的运行速度与C语言非常接近，而且编译速度非常快，就像在使用一个交互式语言。 现有编程语言均未专门对多核处理器进行优化。派克表示，Go就是谷歌工程师为这类程序编写的一种语言。它不是针对编程初学者设计的，但学习使用它也不是非常困难。Go支持面向对象，而且具有真正的封装(closures)和反射(reflection)等功能。 在学习曲线方面，派克认为Go与Java类似，对于Java开发者来说，应该能够轻松学会Go。 之所以将Go作为一个开源项目发布，目的是让开源社区有机会创建更好的工具来使用该语言，例如Eclipse IDE中的插件。目前还没有支持Go的IDE。 在目前谷歌公开发布的所有网络应用中，均没有使用Go。但是谷歌已经使用该语言开发了几个内部项目。 派克表示，Go是否会对谷歌即将推出的Chrome OS产生影响，现在还言之尚早，不过Go的确可以和Native Client配合使用。他表示，“Go可以让应用完美的运行在浏览器内。”例如，使用Go可以更高效的实现Wave，无论是在前端还是后台。

gene ontology

GO（gene ontology）但是它已经成为生物信息领域中一个极为重要的方法和工具，并正在逐步改变着我们对 biological data的组织和理解方式，它的存在已经大大加快了我们对所拥有的生物数据的整合和利用，我们应该逐步学会理解和掌握这种思想和工具。 众所周知，sequence based biology中的核心内容即是对序列的Annotation（注释），其中主要包含structural annotation和functional annotation，前者涉及分析sequence在genome中的locus以及exon，intron，promoter等的location，而后者则是推断序列编码产物的功能，也正是我们在六月论题中所着重探讨的。应该说，这二者是相互关联的。 随着多种生物genome的相继解码，同时大量ESTs以及gene expression profile date的积累，使得annotation的工作量和复杂度大大增加。然而另一方面，大多数基因在不同真核生物中拥有共同的主要生物功能，通过在某些物种中获得的基因或者蛋白质（shared protein）的生物学信息，可以用以解释其他物种中对应的基因或蛋白（especially in comparative genomics）。由于这些繁复的功能信息主要是包含在积累的文献之中，如何有效的提取和综合这些信息就是我们面临的核心困难，这也是GO所要着力解决的问题。通过建立一套具有动态形式的控制字集（controlled vocabulary），来解释真核基因及蛋白在细胞内所扮演的角色，并随着生命科学研究的进步，不断积累和更新。一个ontology会被一个控制字集来描述并给予一定的名称，通过制定“本体”ontologies并运用统计学方法及自然语言处理技术，可以实现知识管理的专家系统控制。 到目前为止，Gene Ontology Consortium（GO的发起组织）的数据库中有3大独立的ontology被建立起来：biological process生物过程, molecular function分子功能及cellular component细胞组分。而这三个ontology下面又可以独立出不同的亚层次，层层向下构成一个ontologies的树型分支结构。可以说， GO是生物学的统一化工具。

“go”在英汉词典中的解释(来源：百度词典)：

GO

abbr.

1. =general order 通令

go

KK: []

DJ: []

vi.

1. 去;离去

2. 行走;旅行;移动[Q]

3. 做(事);从事(活动)[+v-ing]

4. 变为,成为[L]

5. 处于...的状态[L]

6. 衰退;受损;磨损

7. 开始;开动

8. (机器等)运转

9. 通到;延及;至[W][Q]

10. 相配[W]

11. 【数】(除)得整数商[W]

12. 被放置;容得下[W][Q]

13. 售出;归给[(+for/to)]

14. (与must, can, have to 连用)被去掉;被放弃;被辞退

15. (消息等)被传递,流传[W][+that]

16. 被接受;被准许;有效[W]

17. 进行;结果[Q]

18. 发出声响;(钟)报时

19. 完结;死

vt.

1. 拿...打赌[(+on)]

2. 【口】(常用于否定句)忍耐

n.

1. 【口】轮到的机会[C]

2. 【口】尝试[C][(+at)]

3. 【口】精力;精神[U]

4. 【口】意外的事态[S]

5. 去;进行[U]

6. 【口】时髦东西[the S]

话说楼主你问的是哪个方面的啊~

最难的开发语言

第十名、R语言

R语言，一种自由软件编程语言与操作环境，主要用于统计分析、绘图、数据挖掘。R基于S语言的一个GNU计划项目，所以也可以当作S语言的一种实现，通常用S语言编写的代码都可以不作修改的在R环境下运行。R的语法是来自Scheme。

提名词

R语言作者，George Ross Ihaka：在奥克兰大学统计系任副教授，是R语言的最初作者。

2

/10

第九名、Python

颁奖词

Python是一种广泛使用的高级编程语言，属于通用型编程语言。作为一种解释型语言，Python的设计哲学强调代码的可读性和简洁的语法。相比于C++或Java，Python让开发者能够用更少的代码表达想法。不管是小型还是大型程序，该语言都试图让程序的结构清晰明了。

提名词

Python语言作者，Guido van Rossum：生于荷兰哈勒姆，计算机程序员，为Python程序设计语言的最初设计者及主要架构师。

3

/10

第八名、C语言

颁奖词

C是一种通用的编程语言，广泛用于系统软件与应用软件的开发。C语言具有高效、灵活、功能丰富、表达力强和较高的可移植性等特点。C语言编译器普遍存在于各种不同的操作系统中，例如Microsoft Windows、macOS、Linux、Unix等。C语言的设计影响了众多后来的编程语言，例如C++、Objective-C、Java、C#等。

提名词

C语言作者，Dennis MacAlistair Ritchie：美国计算机科学家。黑客圈子通常称他为“dmr”。他是C语言的创造者、Unix操作系统的关键开发者，对计算机领域产生了深远影响，并与肯·汤普逊同为1983年图灵奖得主。

4

/10

第七名、Go

颁奖词

Go（又称Golang）是Google开发的一种静态强类型、编译型、并发型，并具有垃圾回收功能的编程语言。Go的语法接近C语言，但对于变量的声明有所不同。Go支持垃圾回收功能。

提名词

Go语言作者，Robert C. Pike：来自加拿大的程序员，曾经加入贝尔实验室，为 UNIX小组的成员。他与肯·汤普逊共同开发了UTF-8。目前为 google的工程师，参与编程语言 Go与Sawzall的研发工作。

5

/10

第六名、JavaScript

颁奖词

JavaScript，通常缩写为JS，是一种高级的，解释执行的编程语言。JavaScript是一门基于原型、函数先行的语言，是一门多范式的语言，它支持面向对象编程，命令式编程，以及函数式编程。它已经由ECMA（欧洲计算机制造商协会）通过ECMAScript实现语言的标准化。它被世界上的绝大多数网站所使用，也被世界主流浏览器（Chrome、IE、Firefox、Safari、Opera）支持。

提名词

JavaScript语言作者，Brendan Eich：美国程序员与企业家，JavaScript主要创造者与架构师，曾任Mozilla公司的首席技术官，并曾短暂担任首席执行官。

6

/10

第五名、Objective-C

颁奖词

Objective-C是一种通用、高级、面向对象的编程语言。它扩展了标准的ANSI C编程语言，将Smalltalk式的消息传递机制加入到ANSI C中。目前主要支持的编译器有GCC和Clang（采用LLVM作为后端）。

提名词

Objective-C作者，Brad Cox：美国计算机科学家。于傅尔曼大学主修化学与数学，于芝加哥大学取得数学生物学博士学位。Objective-C主要作者。

7

/10

第四名、PHP

颁奖词

PHP（全称：PHP：Hypertext Preprocessor，即“PHP：超文本预处理器”）是开源的通用计算机脚本语言，尤其适用于网络开发并可嵌入HTML中使用。PHP的语法借鉴吸收C语言、Java和Perl等流行计算机语言的特点，易于一般程序员学习。PHP的主要目标是允许网络开发人员快速编写动态页面，但PHP也被用于其他很多领域。

提名词

PHP语言作者，Rasmus Lerdorf：出生于格陵兰岛凯凯塔苏瓦克，是一个丹麦程序员，他拥有加拿大国籍。他也是编程语言PHP的创始人，其中PHP的头两个版本是由他编写的，后来他也参与PHP后续版本的开发。

8

/10

第三名、Java

颁奖词

Java是一种广泛使用的计算机编程语言，拥有跨平台、面向对象、泛型编程的特性，广泛应用于企业级Web应用开发和移动应用开发。Java编程语言是个简单、面向对象、分布式、解释性、健壮、安全与系统无关、可移植、高性能、多线程和动态的语言。

提名词

Java语言作者，James Gosling：出生于加拿大，软件专家，Java编程语言的共同创始人之一，一般公认他为“Java之父”。

9

/10

第二名、C++

颁奖词

C++是一种使用广泛的计算机程序设计语言。它是一种通用程序设计语言，支持多重编程模式，例如过程化程序设计、数据抽象、面向对象程序设计、泛型程序设计和设计模式等。

提名词

C++语言作者，Bjarne Stroustrup：生于丹麦奥胡斯郡，计算机科学家。他以创造C++编程语言而闻名，被称为“C++之父”。

10

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第一名、Visual Basic .NET

颁奖词

Visual Basic .NET（VB.NET）是.NET Framework框架下的一种多重编程范式高级语言。Visual Basic .NET属Basic系语言，其语法特点是以极具亲和力的英文单词为基础标识，以及与自然语言极其相近的逻辑表达，有时候你会觉得写VB.NET代码就好像在写英文句子一样，从这个角度来说，VB.NET似乎是最高级的一门编程语言，当然在Basic系语言中VB.NET也确实是迄今为止最强大的一门编程语言。

提名词

Visual Basic .NET作者，Alan Cooper：交互设计的提倡者。库珀有些时候被叫做 Visual Basic 之父，虽然大多数的工作是由微软的内部开发团队完成的，但是对于Windows可视化设计工具的创意是来源于库珀的。

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