如何用MEGA构建进化树

如何用MEGA构建进化树，很多新手对此不是很清楚，为了帮助大家解决这个难题，下面小编将为大家详细讲解，有这方面需求的人可以来学习下，希望你能有所收获。

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年引用量超大的 MEGA软件，今天小编就先来介绍这个软件的一个小功能-构建进化树。建树之前的两个工作。  

第一步：下载软件      
   

虽说版本都更新到X了，但小编还是比较喜欢用MEGA7这个版本，从官网上下载即可。这个版本的界面是酱紫的。

第二步：整理FASTA格式的文件        

   

序列比对

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（1）打开MEGA软件。点击Align→Edit/Build Alignment→create a new alignment→OK→DNA/Protein；

（2）之后会弹出来这样的界面，点击左边红框里的按钮导入文件，全选之后点击右边序列对比快捷键，进行序列对比；

（3）所有的参数默认，进行序列比对；

（4）保存比对结果，保存为mas文件。

构建进化树

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（1）点击Phylogeny按钮，一般常见的树有两种：Maximum Likehood Tree和Neighbor-Joining Tree，这里我们选择后者举例。导入比对好的序列会出现下图左边的两个图标。敲黑板下一步一定要设置的参数，选择Bootstrap，并设置为1000；

（2）运行，这个过程需要等待；

（3）大功告成，点击下面红框里面的按钮可以进行调整。

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当前题目：如何用MEGA构建进化树
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